ஐரோப்பிய ஜர்னல் ஆஃப் கிளினிக்கல் ஆன்காலஜி

????????????? ?????????? ????????: ??????????????? ????????? ??????????, ??????? ????????? ??????? LAMMPS ?????????????????????? ??????????? ????? ????????? ???????????? ??????????

ரெசா போஜோர்க்பூர்

கணக்கீட்டு நுட்பங்களின் விரைவான முன்னேற்றத்துடன், மூலக்கூறு இயக்கவியல் (MD) உருவகப்படுத்துதல்கள் உயிரியல் மருத்துவ ஆராய்ச்சியில் சக்திவாய்ந்த கருவிகளாக வெளிப்பட்டுள்ளன, அணு மட்டத்தில் உயிரியல் அமைப்புகளின் ஆழமான விசாரணைகளை செயல்படுத்துகின்றன. பல்வேறு வகையான உருவகப்படுத்துதல் மென்பொருட்களில், LAMMPS (பெரிய அளவிலான அணு/மூலக்கூறு மாசிவ்லி பேரலல் சிமுலேட்டர்) அதன் பன்முகத்தன்மை, அளவிடுதல் மற்றும் பரந்த அளவிலான செயல்பாடுகளுக்கு குறிப்பிடத்தக்க அங்கீகாரத்தைப் பெற்றுள்ளது. இந்த இலக்கிய மதிப்பாய்வு உயிரியல் மருத்துவப் பயன்பாடுகள் துறையில் LAMMPS இன் பயன்பாடு பற்றிய விரிவான கண்ணோட்டத்தை வழங்குவதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது.

MD உருவகப்படுத்துதல்களின் அடிப்படைக் கொள்கைகளை கோடிட்டுக் காட்டுவதன் மூலமும், உயிரியல் மருத்துவ ஆராய்ச்சிக்கு ஏற்றதாக இருக்கும் LAMMPS இன் தனித்துவமான அம்சங்களை முன்னிலைப்படுத்துவதன் மூலமும் இந்த மதிப்பாய்வு தொடங்குகிறது. பின்னர், புரத மடிப்பு, மருந்து வடிவமைப்பு, உயிரியல் பொருட்கள் மற்றும் செல்லுலார் செயல்முறைகள் போன்ற பல்வேறு உயிரியல் மருத்துவ சூழல்களில் LAMMPS ஐப் பயன்படுத்திய முக்கிய ஆய்வுகளை அடையாளம் காண இலக்கியத்தின் ஆய்வு நடத்தப்படுகிறது.

மதிப்பாய்வு செய்யப்பட்ட ஆய்வுகள், உயிரியல் மேக்ரோமூலக்யூல்களின் நடத்தையைப் புரிந்துகொள்வதில், மருந்து-புரத தொடர்புகளை ஆராய்வதில், உயிரி பொருட்களின் இயந்திர பண்புகளை தெளிவுபடுத்துவதில் மற்றும் மூலக்கூறு மட்டத்தில் செல்லுலார் செயல்முறைகளைப் படிப்பதில் LAMMPS இன் குறிப்பிடத்தக்க பங்களிப்பை நிரூபிக்கின்றன. கூடுதலாக, இந்த மதிப்பாய்வு LAMMPS இன் பிற கணக்கீட்டு கருவிகள் மற்றும் சோதனை நுட்பங்களுடன் ஒருங்கிணைப்பதை ஆராய்கிறது, இது கோட்பாடு மற்றும் பரிசோதனைக்கு இடையிலான இடைவெளியைக் குறைக்கும் ஒருங்கிணைந்த விசாரணைகளுக்கான அதன் திறனைக் காட்டுகிறது. மேலும், இந்த மதிப்பாய்வு உயிரியல் மருத்துவ உருவகப்படுத்துதல்களில் LAMMPS ஐப் பயன்படுத்துவதில் உள்ள சவால்கள் மற்றும் வரம்புகளைப் பற்றி விவாதிக்கிறது, இதில் சக்தி புலங்களின் அளவுருக்கள், கணினி அளவு வரம்புகள் மற்றும் கணக்கீட்டு திறன் ஆகியவை அடங்கும். உயிரியல் மருத்துவத் துறையில் LAMMPS திறன்களை மேம்படுத்துவதற்கான சாத்தியமான எதிர்கால திசைகளுடன், இந்த சவால்களைத் தணிக்க ஆராய்ச்சியாளர்களால் பயன்படுத்தப்படும் உத்திகள் வழங்கப்படுகின்றன.